El desarrollo del fitoplancton depende de la luz y de la disponibilidad de nutrientes disueltos en el mar: nitratos, nitritos, fosfatos y sílice, entre otros. Una de las fuentes principales de nutrientes en el Mar Patagónico son las aguas subantárticas de la corriente de Malvinas.

El ingreso de nitratos y fosfatos al sistema se relaciona directamente con el aporte que realiza esta corriente. La fuente de algunos nutrientes no ha sido claramente identificada, como en el caso de los nitritos. La descarga continental constituye otra fuente potencial de nutrientes: los silicatos ingresan al mar por el Río de la Plata y, en menor medida, por la corriente de Malvinas.