El Mar Patagónico se encuentra dominado por dos grandes corrientes marinas. La corriente fría de Malvinas, que sigue el contorno del talud continental, constituye la columna vertebral productiva del sistema oceánico. La corriente cálida de Brasil, en cambio, presenta baja concentración de nutrientes. La circulación de las aguas afecta al océano profundo y a la plataforma continental.